序列或氨基酸組成 · a/b/c 與 x/y/z 碎片 · 酶切產物 · 平均 m/z
序列支持單字母(PEPTIDE)、三字母(ALA-GLY-…)、修飾寫法(P(Phos)、[Cit+71.984])與末端(-NH2)。碎片表按 a/b/c、x/y/z 系列與互補自洽關係給出,每行同時列單同位素 m/z 與平均 m/z。輸入方式切到「氨基酸組成」時只填各殘基個數(如 A3R2K1),算整肽分子式、質量與加合離子的平均 m/z;組成沒有順序,所以不出碎片與酶切表。
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肽段分區收兩種輸入:完整序列(單字母 PEPTIDEKRAQ、三字母 ALA-GLY-…、帶修飾的 P(Phos) 或 [Cit+71.984])和只有組成的寫法(A3R2K1)。兩種都會給出整肽分子式、單同位素與平均質量,以及各加合離子的 m/z——平均 m/z 尤其適合對照低分辨或寬包絡儀器上的觀測值。
序列輸入還會展開碎片表:a/b/c 與 x/y/z 系列、次級離子(b-H2O、y-NH3 等)與多價電荷,每行同時列單同位素 m/z 與平均 m/z,互補碎片相加等於母體;並按酶(胰蛋白酶、Lys-C、Glu-C、Asp-N 等)給出酶切產物列表,可設漏切數與長度範圍。組成輸入沒有順序,所以只算整肽,不出碎片與酶切表。
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